Stoffwechselweg
Unter Stoffwechselwegen (engl. metabolic pathways) versteht man die Auf-/Ab- und Umbauprozesse in den Zellen. Es handelt sich um die definierte Abfolge biochemischer Reaktionen, meist von Enzymen katalysiert. Ein Stoffwechselweg entspricht einem einfachen biologischen Prozess, wobei die Abgrenzung zu diesem Begriff fließend ist. 1995 vereinigte Donald Nicholson alle bis dahin bekannten Stoffwechselwege in seinem „Metabolic Pathway Chart“[1].
Stoffwechselwege, geordnet nach Funktion
Wege der Zellatmung
- Fettsäureoxidationen (z. B. α- oder β-Oxidation)
- Cori-Zyklus
- Glykolyse (formale Umkehr: Gluconeogenese)
- Anaerobe Atmung
- Citratzyklus
- Glyoxylatzyklus
- Atmungskette (Oxidative Phosphorylierung)
- Q-Zyklus
Andere Wege
- Cholesterinbiosynthese
- Pentosephosphatweg
- Porphyrinsynthese (oder Hämsynthese)
- Harnstoffzyklus
Biochemische Zyklen
Reaktionsfolgen, in die Metabolite eintreten und denen solche entnommen werden können. Der Ringschluss erfolgt durch Regenerierung oder Nachlieferung des Startmoleküls. Bekanntestes Beispiel: Citratzyklus, die „Drehscheibe des Stoffwechsels“, in dem anabole und katabole Wege der Kohlenhydrate, Proteine und Fette zusammenlaufen. Viele dieser Zyklen wurden nach ihren Entdeckern benannt (Namensreaktionen) und repräsentieren damit ein Stück Biochemie-Geschichte.
- lichtunabhängige Reaktion (Dunkelreaktion) der Photosynthese, in der aus fünf Molekülen einer C3-Verbindung (3-Phosphoglycerat) drei Moleküle des CO2-Akzeptors Ribulose-1,5-bisphosphat, regeneriert werden
- Endabbau einer C2-Verbindung (aktivierte Essigsäure = Acetyl-CoA) unter Bildung von CO2 und GTP sowie den Reduktionsäquivalenten NADH,H+ und FADH2, die in der Atmungskette unter Bildung von H2O oxidiert werden
- Wege des Glukose-Metabolismus unter Beteiligung von Leber und Skelettmuskel
- Ammoniak-Entgiftung in der Leber durch einen Metabolite-Zyklus zwischen Mitochondrien und Cytosol
- C4-Dicarboxylatweg über zwei Zelltypen der C4-Pflanzen
Lynen-Zyklus (Syn. HMG-CoA-Zyklus)
- Bildung von Ketonkörpern (Acetacetat und Folgeprodukte) bei gestörtem Kohlenhydratstoffwechsel (z.B. Diabetes mellitus)
Pentosephosphatzyklus
- Auf- und Abbau von Pentosephosphaten und Bildung von NADPH. Der Pentosephosphatzyklus spielt in den roten Blutkörperchen eine wichtige Rolle.
- zyklischer Elektronenfluss am Komplex III der Atmungskette; Verdopplung der Energieausbeute
- Leerlaufzyklus durch wiederholte Phosphorylierung/Dephosphorylierung eines Metaboliten. Regulatorische Funktion; mögliche Bedeutung bei Wärmeerzeugung
Weblinks
Im WWW sind etliche elektronische Datenbanken mit Stoffwechseldaten frei verfügbar. Eine der wichtigsten ist KEGG:
- http://www.genome.jp/kegg/pathway.html
- WikiPathways - eine Wiki der Wissenschaftsgemeinde, die sich der Archivierung und Verbesserung von Stoffwechselwegen widmet