Edgar Wingender

Edgar Wingender (* 30. September 1952 im niedersächsischem Liebenau) ist ein deutscher Biochemiker, Molekularbiologe und Bioinformatiker. Er ist seit 2002 Professor und Direktor der neu gegründeten Abteilung für Bioinformatik an der Universitätsmedizin Göttingen (UMG).

Leben und Wirken

Edgar Wingender studierte Chemie an der Technischen Universität Braunschweig, wo er 1980 in der Fachrichtung Biochemie über die Struktur des Nukleosoms promovierte. In der anschließenden Postdoktorandenzeit bei Klaus Seifart an der Philipps-Universität Marburg arbeitete er bis 1986 über Transkriptionsfaktoren der RNA-Polymerase III.

Es folgte eine Forschungstätigkeit zum Thema Protein Design an der Gesellschaft für Biotechnologische Forschung (GBF) mbH (heute Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung) in Braunschweig, wo er 1993 das Projekt Bioinformatik der Genregulation initiierte und bis 2002 die Arbeitsgruppe Bioinformatik leitete. In dieser Zeit wurde u.a. die Datenbank TRANSFAC, die er bereits zuvor in privater Initiative begründet hatte, Gegenstand und später wichtige Grundlage einer Reihe von öffentlich geförderten Projekten.

Seit 2002 ist Wingender Professor für Bioinformatik an der Georg-August-Universität Göttingen und Direktor der Abteilung Bioinformatik der Universitätsmedizin Göttingen (UMG).

1997 begründete Wingender die BIOBASE GmbH zum Vertrieb und der weiteren Pflege der Datenbank TRANSFAC. Von 2001 bis 2010 leitete er das Unternehmen als einer von zwei Geschäftsführern (President & CSO). 2010 gründete er gemeinsam mit Alexander Kel in Wolfenbüttel das Unternehmen geneXplain GmbH.

Forschung

Wingenders Forschungsschwerpunkt liegt heute in der bioinformatischen und systembiologischen Erforschung genregulatorischer Netzwerke.

Veröffentlichungen (Auswahl)

Bücher

• E. Wingender (ed.): Biological Petri Nets. Bioinformation Systems / IOS Press, Amsterdam 2010
• E. Wingender: Gene Regulation in Eukaryotes. VCH Weinheim - New York - Basel - Cambridge, 1993

Fachartikel

• Wingender, E.: The TRANSFAC project as an example of framework technology that supports the analysis of genomic regulation. Brief. Bioinform. 9, 326-332 (2008).
• Potapov, A. P., Goemann, B. and Wingender, E.: The pairwise disconnectivity index as a new metric for the topological analysis of regulatory networks. BMC Bioinformatics 9, 227 (2008).
• Kel, A., Voss, N., Valeev, T., Stegmaier, P., Kel-Margoulis, O. and Wingender, E.: ExPlain: finding upstream drug targets in disease gene regulatory networks. SAR QSAR Environ. Res. 19, 481-494 (2008).
• Potapov, A., Liebich, I., Dönitz, J., Schwarzer, K., Sasse, N., Schoeps, T., Crass, T. and Wingender, E.: EndoNet: An information resource about endocrine networks. Nucleic Acids Res. 34, D540-D545 (2006).
• Krull, M., Pistor, S., Voss, N., Kel, A., Reuter, I., Kronenberg, D., Michael, H., Schwarzer, K., Potapov, A., Choi, C., Kel-Margoulis, O. and Wingender, E.: TRANSPATH^®: an Information resource for storing and visualizing signaling pathways and their pathological aberrations. Nucleic Acids Res. 34, D546-D551 (2006).
• Sauer, T., Shelest, E. and Wingender, E.: Evaluating phylogenetic footprinting for human-rodent comparisons. Bioinformatics 22, 430-437 (2006).
• Kel, A. E., Gößling, E., Reuter, I., Cheremushkin, E., Kel-Margoulis, O. V. and Wingender, E.: MATCH^TM: a tool for searching transcription factor binding sites in DNA sequences. Nucleic Acids Res. 31, 3576-3579 (2003).
• Kloos, D.-U., Choi, C. and Wingender, E.: The TGF-β-Smad network: introducing bioinformatic tools. Trends Genet. 18, 96-103 (2002).
• Wingender, E.: Compilation of transcription regulating proteins. Nucleic Acids Res. 16, 1879-1902 (1988).

Weblinks

• Wingender auf der Site der Universität Göttingen
• Persönliche Homepage von E. Wingender
• Vollständige Liste der Veröffentlichungen
• Abteilung Bioinformatik an der Universitätsmedizin Göttingen
• Homepage der geneXplain GmbH