European Nucleotide Archive
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Das European Nucleotide Archive (Europäisches Nukleotid-Archiv; ENA) ist eine der drei großen internationalen Datenbanken über Nukleotidsequenzen. Sie umfasst die EMBL Nucleotide Sequence Database (EMBL-Bank), vormals EMBL Data Library, sowie weitere Datenquellen. Das ENA wird vom Europäischen Bioinformatik-Institute (EBI) gepflegt und bereitgestellt. Gegründet wurde sie 1980 am Europäischen Laboratorium for Molekularbiologie (EMBL) in Heidelberg. Nach Ausgründung des EBI als EMBL-Außenstelle in Hinxton bei Cambridge, UK, übernahm dieses die Weiterführung der Datenbank.
Die EMBL-Bank ist Europas primäres Archiv für Nukleotidsequenzen (DNA- und RNA-Sequenzen). Hauptquelle für ihre Inhalte sind Direkteinreichungen durch die Forscher, die diese Sequenzen bestimmt haben. Die meisten wissenschaftlichen Zeitschriften verlangen einen Nachweis über die Einreichung bei der EMBL-Bank oder einer der Partnerdatenbanken (s. INSDC), bevor sie ein Manuskript mit einer neuen Nukleotidsequenz zur Veröffentlichung annehmen. Release 106 vom Dezember 2010 umfasst nahezu 200 Millionen Einträge.[1] Der Zugang zur EMBL-Bank ist frei und online oder über downloads möglich.
Siehe auch
- Sequenzdatenbank
- Molekularbiologische Datenbank
Einzelnachweise
- ↑ "EMBL Nucleotide Sequence Database: Release Notes", Daten zum jeweils aktuellen Release.
Literatur
- Leinonen R, Akhtar R, Birney E, Bonfield J, Bower L, Corbett M, Cheng Y, Demiralp F, Faruque N, Goodgame N, Gibson R, Hoad G, Hunter C, Jang M, Leonard S, Lin Q, Lopez R, Maguire M, McWilliam H, Plaister S, Radhakrishnan R, Sobhany S, Slater G, Ten Hoopen P, Valentin F, Vaughan R, Zalunin V, Zerbino D, Cochrane G: Improvements to services at the European Nucleotide Archive. In: Nucleic Acids Res. 38. Jahrgang, 2010, S. D39–45.
- Cochrane G, Akhtar R, Bonfield J, Bower L, Demiralp F, Faruque N, Gibson R, Hoad G, Hubbard T, Hunter C, Jang M, Juhos S, Leinonen R, Leonard S, Lin Q, Lopez R, Lorenc D, McWilliam H, Mukherjee G, Plaister S, Radhakrishnan R, Robinson S, Sobhany S, Hoopen PT, Vaughan R, Zalunin V, Birney E: Petabyte-scale innovations at the European Nucleotide Archive. In: Nucleic Acids Res. 37. Jahrgang, 2009, S. D19–25.