Neoschizomer


Als Neoschizomere werden in der Molekularbiologie Paare oder Gruppen von Restriktionsenzymen bezeichnet, welche spezifisch die gleiche Nukleotidsequenz erkennen, diese aber in unterschiedlicher Weise spalten.

Beispiel zweier Neoschizomere
Enzym Quelle Erkennungssequenz Restriktionsschnitt Enden
SmaI Serratia marcescens
5'-CCCGGG-3'
3'-GGGCCC-5'

5'-CCC     GGG-3'
3'-GGG     CCC-5'
kein Überhang
(glatte Enden)
XmaI Xanthomonas malvacearum
5'-C     CCGGG-3'
3'-GGGCC     C-5'
3'–Überhang mit vier Basen
(klebrige Enden)

Weitere Beispiele für Neoschizomerenpaare sind KpnI und Acc65I, SacI und EcoICRI, AatI und ZraI. Abgesehen von der Gleichheit der Erkennungssequenz bestehen zwischen Neoschizomeren oft keine größeren Ähnlichkeiten in Aminosäuresequenz und Struktur. Diese Enzyme werden aus verschiedenen Bakterienstämmen isoliert und stellen oft unterschiedliche Ansprüche für einen optimalen Restriktionsverdau.

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