Deinococcus radiodurans
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Deinococcus radiodurans | ||||||||||
| Systematik | ||||||||||
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| Wissenschaftlicher Name | ||||||||||
| Deinococcus radiodurans | ||||||||||
| (ex Raj et al. 1960) Brooks and Murray 1981 |
Das Deinococcus radiodurans (ehemals als Micrococcus radiodurans bezeichnet) ist ein polyextremophiles Bakterium, das gegen ionisierende Strahlung auch in sehr hohen Dosen resistent ist. Es gehört zu den gram-positiven Kokken, besitzt jedoch eine für gram-negative Bakterien typische Zellwand. Das in der gram-negativen Zellwand enthaltene Lipid A fehlt.
D. radiodurans vermag noch bei chronischen (andauernden) Strahlendosen von 60 Gy pro Stunde zu wachsen und zu gedeihen.[1] Die mittlere Letaldosis LD50, also die akute (kurzdauernde) Strahlendosis, die statistisch bei 50 Prozent der exponierten Organismen zum Tode führt, liegt bei diesen Bakterien bei über 10.000 Gy, ein Teil der Organismen überlebt sogar akute Strahlendosen von bis zu 17.500 Gy.[2] Zum Vergleich: Menschen haben bei einer akuten Bestrahlung ab 6 Gy ohne massive medizinische Intensivversorgung kaum Überlebenschancen (bis zu 90 % Letalität), bei einer Strahlendosis von 7-10 Gy sterben 100 Prozent der Betroffenen innerhalb von ein bis zwei Wochen (LD 100/14). Siehe hierzu auch den Artikel Strahlenkrankheit.
Entdeckung
Deinococcus radiodurans wurde 1956 von Arthur W. Anderson entdeckt, als man Fleischkonserven mit ionisierender Strahlung bestrahlte, um Keime abzutöten. Dabei wurde das Bakterium durch die vergleichsweise geringe Strahlendosis nicht abgetötet und wurde daraufhin eingehender untersucht. Man stellte eine bislang unbekannte Resistenz gegen Ultraviolett- und Röntgenstrahlen fest.
Verbreitung
Deinococcus radiodurans und seine engen Verwandten sind sprichwörtliche Generalisten und Weltenbummler: Neben den Fleischkonserven sind sie auch in Gewebe von atlantischem Schellfisch, Lamakot, antarktischem Gestein und anderen unwirtlichen Orten zu finden. Sie bilden, zusammen mit Cyanobakterien der Art Chroococcidiopsis, eine besondere Gruppe von Organismen, die befähigt ist, unter den härtesten Lebensbedingungen zu gedeihen (Extremophile). Sie sind in der Lage, auch an den lebensfeindlichsten Orten der Welt ökologische Nischen zu finden und sind deshalb ubiquitär verbreitet, unter anderem auch im Kühlwasserkreislauf von Atomreaktoren sowie im Darm von Menschen.[3][4]
Genom
Das Genom von D.radiodurans besteht aus 4 zirkulären Molekülen:
- Chromosom I mit 2.648.638 bp
- Chromosom II mit 412.348 bp
- Megaplasmid mit 177.466 bp
- Plasmid mit 45.704 bp
Man vermutet, dass das Chromosom II für den Organismus essentiell ist.[5]
Strahlenresistenz
Hauptverantwortlich für die extreme Strahlenresistenz gegen ionisierende Strahlung ist die Fähigkeit, defekte DNS außergewöhnlich effizient zu reparieren.[6][4] DNS und Teile von Chromosomen, die durch Mutagene wie Strahlung, chemische Einwirkung oder auch zufällige Ursachen Schaden erlitten haben, werden mit Hilfe von bestimmten Enzymen besonders schnell und effektiv wieder instandgesetzt. Dieser Reparaturmechanismus erlaubt sogar das Beheben von Doppelstrangbrüchen, einer besonders schweren Form der DNS-Schädigung. Auf diese Weise ist Deinococcus radiodurans in der Lage, gleichzeitig 500 solcher Reparaturen auszuführen, während beispielsweise das Darmbakterium Escherichia coli allenfalls zwei bis drei schafft. D.radiodurans verfügt über vier Kopien des Genoms in der stationären Phase und über acht bis zehn Kopien während des exponentiellen Wachstums. Auch andere Bakterien haben multiple Genomkopien (Micrococcus luteus, Micrococcus sodonensis), diese sind aber strahlensensitiv. Daher hat die Vielfachheit des Genoms alleine keinen Einfluss auf die Strahlenresistenz.[7] Bislang sind die molekularen Gegebenheiten, die diese ungewöhnliche Reparaturleistungen ermöglichen, noch nicht hinreichend aufgeklärt.
Außerdem besitzt das Bakterium eine sehr starke Zellwand, die es auch vor UV-Strahlung schützt.
Ein weiteres extrem strahlungsresistentes Bakterium ist das halophile Halobacterium sp. NRC-1, von dem es Mutanten gibt, die akute Strahlendosen von bis zu 11.000 Gy überleben.[8]
Bedeutung
Exobiologie
Für Exobiologen, die nach Spuren außerirdischen Lebens suchen, sind Überlebenskünstler wie Deinococcus radiodurans und Chroococcidiopsis von großem Interesse, da es denkbar ist, dass solche Organismen verborgen in Meteoritgesteinen unversehrt weite Reisen durch das Weltall überleben könnten.[9][10] Dies würde die Hypothese der Panspermie stärken, die besagt, dass einfache Lebensformen in der Lage sind, sich über große Distanzen durch das Universum zu bewegen. Einige könnten so vor etwa 3,5 Milliarden Jahren den Weg zur Erde gefunden und so den Ursprung des Lebens auf diesem Planeten gebildet haben.
Informationstechnik
Ihre besondere Widerstandsfähigkeit gegen schädigende Einwirkungen aller Art könnte Deinococcus radiodurans für die Anwendung als Datenspeicher in der Informationstechnologie interessant machen. So wird derzeit erforscht, wie Daten in Form künstlicher DNA in den Bakterien gespeichert und wieder abgerufen werden können. US-amerikanische Informatiker übersetzten den Text des englischen Kinderliedes It's a Small World in den genetischen Code und schleusten die entsprechende DNA-Sequenz in das Erbgut der Bakterien ein. Noch nach etwa hundert Bakteriengenerationen ließen sich die Strophen in unveränderter Form mit üblicher Sequenziertechnik wieder auslesen, d.h. die eingebrachte Information wurde stabil abgespeichert und zusätzlich durch die Vermehrung der Bakterien ihre Redundanz erhöht.[11]
Einzelnachweise
- ↑ Makarova KS, Aravind L, Wolf YI, Tatusov RL, Minton KW, Koonin EV, Daly MJ.: Genome of the extremely radiation-resistant bacterium Deinococcus radiodurans viewed from the perspective of comparative genomics. In: Microbiol Mol Biol Rev. Band 65, Nr. 1, März 2001, S. 44–79 (PMID 11238985).
- ↑ Daly MJ, Minton KW.: Recombination between a resident plasmid and the chromosome following irradiation of the radioresistant bacterium Deinococcus radiodurans. In: Gene. Band 187, Nr. 2, März 1997, S. 225–229 (PMID 9099885).
- ↑ E.M. Bik,P.B. Eckburg, S.R. Gill, K.E. Nelson, E.A. Purdom, F. Francois, G. Perez-Perez, M.J. Blaser, D.A. Relman: Molecular analysis of the bacterial microbiota in the human stomach. In: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Band 103, Nr. 3, 17. Januar 2006, S. 732–737 (PMID 16407106).
- ↑ 4,0 4,1 R. Froböse:: Wenn Frösche vom Himmel fallen: die verrücktesten Naturphänomene Wiley-VCH Verlags-GmbH & Co. KGaA Weinheim 2007, ISBN 978-3-527-31659-5, S. 19ff
- ↑ Owen White et al.: Genome Sequence of the Radioresistant Bacterium Deinococcus radiodurans R1. In: Science. Band 286, Nr. 5444, 19. November 1999, S. 1571 - 1577.
- ↑ Blasius M, Sommer S, Hübscher U.: Deinococcus radiodurans: what belongs to the survival kit? In: Crit Rev Biochem Mol Biol. Band 43, Nr. 3, 2008, S. 221–228 (PMID 18568848).
- ↑ Harsojo, S. Kitayama, and A. Matsuyama: Genome multiplicity and radiation resistance in Micrococcus radiodurans. In: The Journal of Biochemistry. Band 90, Nr. 3, 1981, S. 877–880 (PMID 7309705).
- ↑ DeVeaux LC, Müller JA, Smith J, Petrisko J, Wells DP, DasSarma S.: Extremely radiation-resistant mutants of a halophilic archaeon with increased single-stranded DNA-binding protein (RPA) gene expression. In: Radiat Res. Band 168, Nr. 4, Oktober 2007, S. 507–514 (PMID 17903038).
- ↑ B. Diaz, (et al.) Microbial survival rates of Escherichia coli and Deinococcus radiodurans under low temperature, low pressure, and UV-Irradiation conditions, and their relevance to possible Martian life. Astrobiology. Vol.6, No.2, Apr. 2006, S. 332-47.Abstract bei PubMed
- ↑ Comparative Survival Analysis of D. radiodurans, N. magadii, and H. volcanii Exposed to Vacuum Ultraviolet Irradiation spaceref.com, abgerufen am 5. Oktober 2011
- ↑ Strahlenresistente Bakterien als dauerhafte Datenspeicher. In: Netzzeitung. 10. Januar 2003, abgerufen am 11. Februar 2009.
Weiterführende Literatur
- M. Blasius, S. Sommer, U. Hübscher: Deinococcus radiodurans: what belongs to the survival kit? In: Critical reviews in biochemistry and molecular biology Band 43, Nummer 3, 2008 May-Jun, S. 221–238, ISSN 1549-7798. doi:10.1080/10409230802122274. PMID 18568848. (Review).
- M. J. Daly: Modulating radiation resistance: Insights based on defenses against reactive oxygen species in the radioresistant bacterium Deinococcus radiodurans. In: Clinics in laboratory medicine Band 26, Nummer 2, Juni 2006, S. 491–504, x, ISSN 0272-2712. doi:10.1016/j.cll.2006.03.009. PMID 16815462. (Review).
- M. M. Cox, J. R. Battista: Deinococcus radiodurans - the consummate survivor. In: Nature reviews. Microbiology Band 3, Nummer 11, November 2005, S. 882–892, ISSN 1740-1526. doi:10.1038/nrmicro1264. PMID 16261171. (Review).
- J. Englander, E. Klein, V. Brumfeld, A. K. Sharma, A. J. Doherty, A. Minsky: DNA toroids: framework for DNA repair in Deinococcus radiodurans and in germinating bacterial spores. In: Journal of bacteriology Band 186, Nummer 18, September 2004, S. 5973–5977, ISSN 0021-9193. doi:10.1128/JB.186.18.5973-5977.2004. PMID 15342565. PMC 515169 (freier Volltext). (Review).
- K. S. Makarova, L. Aravind, Y. I. Wolf, R. L. Tatusov, K. W. Minton, E. V. Koonin, M. J. Daly: Genome of the extremely radiation-resistant bacterium Deinococcus radiodurans viewed from the perspective of comparative genomics. In: Microbiology and molecular biology reviews : MMBR Band 65, Nummer 1, März 2001, S. 44–79, ISSN 1092-2172. doi:10.1128/MMBR.65.1.44-79.2001. PMID 11238985. PMC 99018 (freier Volltext). (Review).
- R. Rajan, C. E. Bell: Crystal structure of RecA from Deinococcus radiodurans: insights into the structural basis of extreme radioresistance. In: Journal of molecular biology Band 344, Nummer 4, Dezember 2004, S. 951–963, ISSN 0022-2836. doi:10.1016/j.jmb.2004.09.087. PMID 15544805.
- S. Levin-Zaidman, J. Englander, E. Shimoni, A. K. Sharma, K. W. Minton, A. Minsky: Ringlike structure of the Deinococcus radiodurans genome: a key to radioresistance? In: Science (New York, N.Y.) Band 299, Nummer 5604, Januar 2003, S. 254–256, ISSN 1095-9203. doi:10.1126/science.1077865. PMID 12522252.
- D. Frenkiel-Krispin, A. Minsky: Biocrystallization: A last-resort survival strategy in bacteria. In: ASM News 68, 2002, S. 277–283.
- A. Minsky, E. Shimoni, D. Frenkiel-Krispin: Stress, order and survival. In: Nature reviews. Molecular cell biology Band 3, Nummer 1, Januar 2002, S. 50–60, ISSN 1471-0072. doi:10.1038/nrm700. PMID 11823798. (Review).
- R. Goobes, A. Minsky: Thermodynamic aspects of triplex DNA formation in crowded environments. In: Journal of the American Chemical Society Band 123, Nummer 50, Dezember 2001, S. 12692–12693, ISSN 0002-7863. PMID 11741440.
- Heike Zimmermann: Wirkung locker- und dichtionisierender Strahlung auf Zellen von Deinococcus radiodurans. Dissertation, Institut für Luft- und Raumfahrtmedizin, Universität Köln, 1994.