Glycerinaldehyd-3-phosphat-Dehydrogenase
| Glyceraldehyd-3-Phosphat-Dehydrogenase | ||
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| Oberflächen-/Bändermodell des GAPDH-Tetramer, nach PDB 1U8F | ||
| Vorhandene Strukturdaten: 1j0x, 1u8f, 1znq, 2feh, 3gpd | ||
| Eigenschaften des menschlichen Proteins | ||
| Masse/Länge Primärstruktur | 334 aa; 35,9 kDa | |
| Sekundär- bis Quartärstruktur | Homotetramer | |
| Kofaktor | PRKCI, Sulfat | |
| Bezeichner | ||
| Gen-Namen | GAPDH; GAPD | |
| Externe IDs | OMIM: 138400 UniProt: P04406 MGI: 3646088 | |
| Enzymklassifikation | ||
| EC, Kategorie | 1.2.1.12 Oxidoreduktase | |
| Reaktionsart | Phosphorylierung | |
| Substrat | D-Glyceraldehyd-3-phosphat + Phosphat + NAD(+) | |
| Produkte | 3-Phospho-D-glyceroylphosphat + NADH | |
| Vorkommen | ||
| Homologie-Familie | HBG269967 | |
| Übergeordnetes Taxon | Lebewesen | |
| Orthologe | ||
| Mensch | Huhn | |
| Entrez | 2597 | 374193 |
| Ensembl | ENSG00000111640 | ENSGALG00000014442 |
| UniProt | P04406 | P00356 |
| Refseq (mRNA) | NM_002046 | NM_204305 |
| Refseq (Protein) | NP_002037 | NP_989636 |
| Genlocus | Chr 12: 6.51 – 6.52 Mb | Chr 1: 80.09 – 80.09 Mb |
| PubMed-Suche | 2597 | 374193
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Die Glycerinaldehyd-3-phosphat-Dehydrogenase (GAPDH) ist ein Enzym der Glycolyse und daher unentbehrlich für alle Lebewesen. Sie katalysiert die Umwandlung von Glycerinaldehyd-3-Phosphat zu 1,3-Bisphosphoglycerat. Bei dieser Reaktion wird eine energiereiche Phosphat-Bindung aufgebaut, die im folgenden Schritt der Glycolyse auf ADP übertragen wird, wodurch ATP entsteht. Außerdem wird in der katalysierten Reaktion ein NAD+ zu NADH/H+ umgewandelt.
Katalytischer Mechanismus
Das Hauptproblem der Reaktion stellt die Abspaltung des H--Ion (Hydridion) von der Aldehydgruppe des Glycerinaldehyd-3-Phosphats dar. Dies ist energetisch ungünstig, da der Kohlenstoff in der Aldehydgruppe eine positive Partialladung trägt. Durch die kovalente Bindung einer Sulfhydrylgruppe eines Cysteins des Enzyms wird ein nukleophiler Rest eingeführt. Dadurch löst sich das Hydridion und zwischen Enzym und Substrat entsteht ein Thioester. Diese energiereiche Verbindung wird in der nachfolgenden Reaktion benutzt um ein anorganisches Phosphat zu binden und das Zwischenprodukt in 1,3-Bisphosphoglycerat umzuwandeln. Das Hydridion bindet mittlerweile an ein nicht-kovalent gebundenes NAD+, so dass NADH/H+entsteht. Dieses löst sich aus der Bindung mit dem Enzym und wird durch ein NAD+ ersetzt um den ursprünglichen Zustand wiederherzustellen.[1]
Die katalysierte Reaktion nimmt energetisch einen hohen Stellenwert ein. Das entstandene gemischte Anhydrid aus Phosphor- und Carbonsäure wird in der nachfolgenden Reaktion zur ATP-Bildung verwendet. Aus dem NADH/H+ kann wiederum ATP in der Atmungskette gebildet werden.[2]
Hemmung
Die Bildung des energiereichen Anhydrids und von NADH+/H+ ist durch Arsen hemmbar. AsO43- bindet dabei analog zum Phosphat an die GAPDH. Die Bindung zwischen dem Substrat und Arsenat ist jedoch sehr instabil, so dass dieses zu 3-Phosphoglycerat zerfällt. Dadurch wird ein energiefixierender Schritt in der Glykolyse übersprungen, was zur Giftwirkung des Arsens beiträgt.[3]
