Liste der Pflanzenviren
Die Taxonomie der Pflanzenviren fasst alle Virusfamilien und -gattungen zusammen, in denen pflanzenpathogene Viren (Pflanzenviren) vertreten sind. Sie folgt den Grundsätzen der Virus-Taxonomie, nach der die wesentlichen taxonomischen Unterscheidungsmerkmale das Vorhandensein einer Virushülle, die Symmetrie des Kapsids und die Art des Genoms sind. Die Nukleinsäure, die im Virion das Genom bildet, kann aus RNA oder DNA bestehen, jeweils als einzelner Strang (linear), zu einem Kreis kovalent geschlossen (zirkulär) oder in mehreren Stücken (segmentiert); die Nukleinsäure kann einzelsträngig (single-stranded, ss) oder doppelsträngig (double-stranded, ds) vorliegen. Nach der Polarität einer einzelsträngigen Nukleinsäure unterscheidet man negative ss(-), positive ss(+) und ambisense ss(-/+) Genome. Bei einigen Pflanzenviren wird während der Vermehrung durch eine Reverse Transkriptase (RT) RNA in DNA umgeschrieben.
Die überwiegende Zahl der aufgeführten Familien enthalten ausschließlich Pflanzenviren, lediglich drei Familien umfassen auch Gattungen mit animalen Viren (Reoviridae, Rhabdoviridae, Bunyaviridae). Viele Gattungen von Pflanzenviren sind nach den Festlegungen des ICTV noch keiner Familie zugeordnet (nicht klassifiziert, n. k.).
Familie | Gattung | Genom | Virushülle | Symmetrie/Form |
---|---|---|---|---|
Caulimoviridae | Caulimovirus, Petuvirus, Soymovirus, Cavemovirus, Badnavirus, Tungrovirus | dsDNA (RT), zirkulär | keine | ikosaedrisch, bazilliform |
Geminiviridae | Mastrevirus, Curtovirus, Topocuvirus, Begomovirus | ss(+/-)DNA, zirkulär, segmentiert (1-2) | keine | ikosaedrisch, sphärisch[1] |
Nanoviridae | Nanovirus, Babuvirus | ss(+)DNA, zirkulär, segmentiert (6-9) | keine | ikosaedrisch, sphärisch |
Reoviridae[2] | Fijivirus, Phytoreovirus, Oryzavirus | dsRNA, segmentiert (10-12) | keine | ikosaedrisch, sphärisch |
Partitiviridae | Alphacryptovirus, Betacryptovirus | dsRNA, segmentiert (2) | keine | ikosaedrisch, sphärisch |
n.k. | Endornavirus | dsRNA, linear | – [3] | – |
Pseudoviridae | Pseudovirus[4], Sirevirus | ssRNA (RT) | – [5] | ikosadrisch, sphärisch |
n. k. | Varicosavirus | ss(-)RNA, segmentiert (2) | keine | helikal, stäbchenförmig |
Sequiviridae | Sequivirus, Waikavirus | ss(+)RNA, linear | keine | ikosaedrisch, sphärisch |
n.k. | Sadwavirus | ss(+)RNA, segmentiert (2) | keine | ikosaedrisch, sphärisch |
n.k. | Cheravirus | ss(+)RNA, segmentiert (2) | keine | ikosaedrisch, sphärisch |
Tombusviridae | Tombusvirus, Aureusvirus, Avenavirus, Carmovirus, Necrovirus, Panicovirus, Machlomovirus | ss(+)RNA, linear | keine | ikosaedrisch, sphärisch |
Tombusviridae | Dianthovirus | ss(+)RNA, segmentiert (2) | keine | ikosaedrisch, sphärisch |
Tymoviridae | Tymovirus, Marafivirus, Maculavirus | ss(+)RNA, linear | keine | ikosaedrisch, sphärisch |
Bromoviridae | Alfamovirus, Bromovirus, Cucumovirus, Ilarovirus, Oleavirus | ss(+)RNA, segmentiert (3) | keine | ikosaedrisch, sphärisch bis bazilliform |
Comoviridae | Comovirus, Fabavirus, Nepovirus | ss(+)RNA, segmentiert (2) | keine | ikosaedrisch, sphärisch |
Luteoviridae | Luteovirus, Polerovirus, Enamovirus | ss(+)RNA, linear | keine | ikosaedrisch, sphärisch |
n. k. | Umbravirus | ss(+)RNA, linear | keine | keine[6] |
n. k. | Sobemovirus | ss(+)RNA, linear | keine | ikosaedrisch, sphärisch |
n. k. | Idaeovirus | ss(+)RNA, segmentiert (2) | keine | ikosaedrisch, sphärisch |
n. k. | Ourmiavirus | ss(+)RNA, segmentiert (3) | keine | ikosaedrisch, bazilliform |
n. k. | Tobamovirus | ss(+)RNA, linear | keine | helikal, stäbchenförmig |
n. k. | Tobravirus | ss(+)RNA, segmentiert (2) | keine | helikal, stäbchenförmig |
n. k. | Hordeivirus | ss(+)RNA, segmentiert (3) | keine | helikal, stäbchenförmig |
n. k. | Furovirus | ss(+)RNA, segmentiert (2) | keine | helikal, stäbchenförmig |
n. k. | Pomovirus | ss(+)RNA, segmentiert (3) | keine | helikal, stäbchenförmig |
n. k. | Pecluvirus | ss(+)RNA, segmentiert (2) | keine | helikal, stäbchenförmig |
n. k. | Benyvirus | ss(+)RNA, segmentiert (4-5) | keine | helikal, stäbchenförmig |
Potyviridae | Potyvirus, Ipomovirus, Macluravirus, Rymovirus, Tritimovirus | ss(+)RNA, linear | keine | helikal, filamentös |
Potyviridae | Bymovirus | ss(+)RNA, segmentiert (2) | keine | helikal, filamentös |
Closteroviridae | Closterovirus, Ampelovirus | ss(+)RNA, linear | keine | helikal, filamentös |
Closteroviridae | Crinivirus | ss(+)RNA, segmentiert (2) | keine | helikal, filamentös |
Flexiviridae | Potexvirus, Mandarivirus, Allexivirus, Carlavirus, Foveavirus, Capillovirus, Vitivirus, Trichovirus | ss(+)RNA | keine | helikal, filamentös |
Rhabdoviridae[7] | Cytorhabdovirus, Nucleorhabdovirus | ss(-)RNA, linear | vorhanden | helikal, bazilliform |
Bunyaviridae[8] | Tospovirus | ss(-/+)RNA und (-)RNA, segmentiert (3)[9] | vorhanden | ikosaedrisch, sphärisch |
n. k. | Tenuivirus | ss(+/-)RNA und (-)RNA[10], segmentiert (4-6) | keine | filamentös[11] |
n. k. | Ophiovirus | ss(-)RNA, segmentiert (3-4) | keine | helikal, filamentös |
Anmerkungen
- ↑ Stets zwei gekoppelte, ikosaedrische Kapside bilden ein Virion
- ↑ Familie enthält auch Virusgattungen bei Wirbeltieren, Insekten und Pilzen
- ↑ Virus nur in Zellen präsent, es existieren keine extrazellulären Virionen
- ↑ Gattung enthält auch Virusspezies bei Pilzen
- ↑ Ikosaedrische Partikel sind nur intrazellulär vorhanden, es existieren keine extrazellulären Virionen
- ↑ Unregelmässiger Nukleoprotein-Komplex
- ↑ umfasst auch Virusgattungen bei Wirbeltieren und Insekten
- ↑ umfasst überwiegend Virusgattungen bei Wirbeltieren und Insekten
- ↑ Die Segmente M und S besitzen ambisense, das Segment L negative Polarität
- ↑ Ein Segment ist stets ss(-)RNA, die weiteren 3-5 Segmente besitzen eine ambisense-Polarität
- ↑ Nukleoprotein-Komplex
Quellen
- C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London, San Diego, 2005, ISBN 0-12-249951-4
- Sondra D. Lazarowitz: Plant Viruses. In: David M. Knipe, Peter M. Howley (eds.-in-chief): Fields’ Virology. 5. Auflage, 2 Bände Philadelphia 2007, S. 641-705, ISBN 0-7817-6060-7
- Gerhart Drews, Günter Adam, Cornelia Heinze: Molekulare Pflanzenvirologie, Berlin 2004, ISBN 3540006613