In der Biologie ist Taxonomie die Wissenschaft des Benennens, Definierens (Umschreibens) und Klassifizierens von Gruppen biologischer Organismen auf der Grundlage von gemeinsamen Merkmalen. Organismen werden zu Taxa (Singular: Taxon) zusammengefasst, und diese Gruppen erhalten einen taxonomischen Rang.
Gruppen eines bestimmten Ranges können zu einer Supergruppe mit höherem Rang zusammengefasst werden, wodurch eine taxonomische Hierarchie entsteht. Die Hauptränge in der modernen Taxonomie sind Domäne, Königreich, Stamm (in der Botanik wird manchmal Abteilung anstelle von Stamm verwendet), Klasse, Ordnung, Familie, Gattung und Art.
Der schwedische Botaniker Carl Linnaeus gilt als Begründer des gegenwärtigen Taxonomiesystems, da er ein System entwickelte, das als linnäische Taxonomie zur Kategorisierung von Organismen und als Binomialnomenklatur zur Benennung von Organismen bekannt ist.
Mit dem Aufkommen von Forschungsgebieten wie Phylogenetik, Kladistik und Systematik hat sich das linnäische System zu einem System moderner biologischer Klassifikation entwickelt, das auf den evolutionären Beziehungen zwischen lebenden und ausgestorbenen Organismen basiert.